有兩種類型的變速方法：自動變速操作的“AT模式”和允許騎手始終選擇他/她最喜歡的檔位的“MT模式”。在“AT模式”下，除了正常的“D模式”外，還可以選擇適合運動駕駛的“S模式”。而且，根據駕駛情況，可以通過換檔開關隨時換檔，換檔後自動返回AT模式。CRF1100L Africa Twin配備了6軸IMU（慣性傳感器），可檢測俯仰、滾轉和偏航角速度和加速度。轉彎檢測控制的加入，讓換擋時機更加貼近騎手的感覺，成熟的起步控制和換擋控制實現了安全感和直接感。